MaxLinesPerSecondを1000に設定すると
Zabbixエージェントにて検知したログをZabbixサーバへ秒間で1000行まで送信できる認識です。

こちらについて、『アイテム単位』での上限か『サーバ単位』での上限かを検証したところ、
『アイテム単位』での上限であることが分かりました。

『サーバ単位』での検知ログの秒間送信上限行数はございますでしょうか。