> エージェントを利用した監視は問題なく実施できますでしょうか。
> アクティブチェックも問題なく実施できますでしょうか。
特に大きな問題はありません
サーバ・エージェント間の通信仕様は、現在のところ、互換性を維持するように
拡張されているので、全く通信できない、監視できない、等は起こりません

ただし、以下の制約にはご注意ください
・エージェントのバージョンによってサポートされるアイテムキーが一部変化すること
・サーバ側の標準テンプレート等で定義されているアイテムは、同じバージョンの
　エージェントを利用する想定となっているので、そのままでは正しく動作しない可能性がありうること

> 3.0から実装された暗号化通信は動作しますでしょうか。
エージェントだけが暗号化をサポートしていても、サーバと「暗号化して通信」ができなければ
不可能です
よって、暗号化機能については、サーバ側・エージェント側の双方が、暗号化通信をサポートする版で
あること、が最低要件となります
※）他のフォーラム書き込みにもありますが、zabbix そのものの版が 3.0 でも、一部OS向けに提供されている
　ビルド済パッケージでは、依存ライブラリのバージョン等制限によって、暗号化通信機能が利用できない
　ことがあります。よくご確認ください