Server3台のHA構成で、監視対象のログ監視を行いたいのですが、
AgentのコンフィグにServer3台分のIPアドレスを記載することで、
Active Checkが動作するようになるのでしょうか？

Zabbixエージェントの設定のServerActiveに、Zabbixサーバーすべ
てのIPアドレスを「セミコロン」で区切って記述してください。
Zabbixエージェントの設定のServerには、Zabbixサーバーすべての
IPアドレスを「カンマ」で区切って記述してください。

以前質問させていただいたときに、Active Checkで
複数台のServerIPアドレスを指定することはできない、と
ご回答いただいたので、HAではどうなのか質問させていただきました。

記述できないわけではなく、これまでのServerActiveにカンマ区切
りで列挙する方法では、記述したZabbixサーバーは別のサーバーに
なります。
複数の別のZabbixサーバーから監視をしたいのであれば、この設定
方法を使用します。

Zabbix 6.0のHA機能を使用するのであれば、上記の通りです。