単純にデータを削除しても、ホストやアイテムを減らしたり、監視
間隔を伸ばすということをしないのであれば、そのサーバーの設定
のままでは、すぐに遅くなってしまうと思います。
Zabbixを使用されているのであれば、何が原因で遅くなっているの
かをもう少し調べてみてはいかがでしょうか？

DBMSを稼働させているサーバー上の空きメモリに余裕があるのであ
れば、DBMSに割り当てるメモリを増やせばパフォーマンスを改善す
ることができる可能性があります。

また、SQL側の容量というのは、何の容量でしょうか？
DBMSを稼働させているサーバー上のハードディスクの空き容量です
か？