satさん

いただいた情報の、ソースファイルのどこかを編集してからブラウザをリロードすることで
ミュートの設定の確認、変更が可能ということでしょうか？

アラートのポップアップするタイミングですが、
getServerMessages関数が呼ばれてAJAXでサーバからJSON形式のデータをserverRespond関数が受け取った時なんですよ。
※：Chromeのデベロッパーツールでブレーク貼るとわかりやすいです。

で、getServerMessages関数はリロードしたタイミングと画面表示から60秒周期で呼ばれるんです。

なので、アラートのポップアップのタイミングで反映するならブラウザの強制リロードかければ反映するかなと…A(^^;

PHPをざっと見てみましたが、ミュートのOn/Offは、あのウィンドウ
からのみ操作できるようになっていて、他の箇所にミュートの状態
を変更するボタンなどは用意されていないようです。

データベースを参照して良いのであれば、profilesテーブル内の
sourceが「sounds.mute」のvalue_strの値を確認してみてください。

例：

mysql> select userid,source,value_str from profiles where userid=1 and source='sounds.mute';
+--------+-------------+-----------+
| userid | source | value_str |
+--------+-------------+-----------+
| 1 | sounds.mute | 0 |
+--------+-------------+-----------+
1 row in set (0.00 sec)

mysql>

value_strが「0」なら音あり、「1」ならミュートの状態のようです。