■Zabbixサーバは、アプライアンスサーバを使用予定

とのことですが、どのアプライアンスサーバを想定されていますか？

Zabbix SIAのダウンロードページからダウンロードできるアプライ
アンスですか？
http://www.zabbix.com/download.php

それともZabbix Japan LLCから提供されているZabbix Enterprise
Appliance ZS-5220ですか？
http://enterprise.zabbix.co.jp/products/zs5220

また、Job Schedulerとありましたが、SOSがリリースしている
JobSchedulerのことでよろしいですか？

まず、Zabbix SIAからダウンロードできるアプライアンスは、OSが
OpenSUSEベースのものとなっています。
その場合、JobScheduler MasterのサポートOSには、OpenSUSEは含
まれていないようです。
https://kb.sos-berlin.com/pages/viewpage.action;jsessionid=DE5E5F453F1E7...

また、ZS-5220は、Debianベースであったと思いますので、同様に
JobScheduler MasterのサポートOSには含まれていません。

さらに、HyClops JobMonitoringの検証済みOSは、CentOS 6である
ようです。

ですので、ZabbixとSOS JobSchedulerをHyClops JobMonitoringで
連携させて利用されたいのであれば、現時点では、CentOS 6もしく
はRHEL 6上で環境を構築する必要があると思います。

インストール方法に関しては、以下のHyClops JobMonitoringのサ
イトをご確認ください。

ご参考：
　HyClops JobMonitoring
　　 http://tech-sketch.github.io/hyclops_jm/jp/
　SOS JobScheduler
　　 http://www.sos-berlin.com/jobscheduler