ZabbixサーバとZabbixエージェント間の通信は、TCP/IPを利用しています。

もう少し具体的に書くと、デフォルトでは、ZabbixサーバからZabbixエージェントに接続する際にはポート番号10050を利用し、ZabbixエージェントからZabbixサーバに接続する際にはポート番号10051を利用します。

デフォルトのポート番号以外のポート番号を使用したい場合は、設定ファイルで変更することができます。
ただし、使用するポート番号を変更する際には、

　・Zabbixサーバの設定ファイル
　・Zabbixエージェントの設定ファイル
　・Zabbixサーバ上に登録されている監視対象の設定

で指定しているポート番号の対応の整合性を保つことが必要です。